常長は，１６２０年９月２２日に，彼の故郷である仙台に帰っている。常長は，正宗に帰朝の報告をしたが，「南蛮国ノ事物，六右衛門物語の趣，奇怪最多シ」（貞山公治家記録）と記録されているように，常長がいくら説明をしてもうまく伝わらなかったことが想像される。無理もないとは思うが，，，。
さらに，１６２０年１１月６日に信徒を処刑するなど，正宗のキリシタンへの仕置き（１６２３カルバリヨ神父らが大晦日，水牢で殉教，殉教の碑・冬の広瀬川と大橋）は，徐々に厳しくなってきている。
そのようなこともあり，洗礼を受け帰国した常長の終焉は，謎に覆われている。彼の墓だとされるものも，仙台市北山の光明寺（ここには，常長に同行したソテロの顕彰碑がある。），黒川郡大郷町東成田，柴田郡川崎町支倉の三カ所に確認されている。また，亡くなった日についても，川崎町の墓の解説では，元和８年７月１日（１６２２年８月７日），五十二歳とし，大郷町の解説では，帰国後三十年の二月（１６５０），八十四歳としている。
